Charles Supper? 公司 超蛋白線材模型折彎?rùn)C(jī)

超級(jí)蛋白質(zhì)絲模型彎曲機(jī)，
也被稱為拜倫的彎曲機(jī)，
可以制作一個(gè)整體的蛋白質(zhì)-碳模型。

超蛋白線材模型折彎?rùn)C(jī)是一種易于加工的設(shè)備α-通過(guò)在一
根連續(xù)長(zhǎng)度的鋼棒上放置適當(dāng)?shù)膹澢葋?lái)建立蛋白質(zhì)分子
的碳骨架模型。該模型可以在任何規(guī)模縮小到約4毫米/?.
在這種尺寸下，模型可以完全獨(dú)立，因此不需要外部支持
的網(wǎng)絡(luò)。它們足夠小，只需要很少的存儲(chǔ)空間，足夠堅(jiān)固，
能夠經(jīng)受住頻繁的搬運(yùn)和研究。
目前已經(jīng)有好幾種類型的蛋白質(zhì)模型，但是它們都需要精確
地將大量的小片段連接在一起，因此構(gòu)建的成本和難度限制
了它們的使用。幸運(yùn)的是，bender產(chǎn)生的簡(jiǎn)單的單件蛋白質(zhì)
模型可以服務(wù)于三維模型最有價(jià)值的許多功能。它們以異常
清晰的方式展示了每個(gè)蛋白質(zhì)的整體折疊模式，特別適合于
比較一個(gè)分子內(nèi)或同源蛋白質(zhì)之間結(jié)構(gòu)相似的區(qū)域。這些模
型通過(guò)在骨架上添加配體和一些選定的側(cè)鏈，展示了酶活性
位點(diǎn)的三維幾何結(jié)構(gòu)，這在生化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中是非常有用的。
這些骨干模型對(duì)于教學(xué)非常有用，既可以作為課堂展示，也
可以作為學(xué)生制作自己的蛋白質(zhì)模型以供學(xué)習(xí)和保存的實(shí)驗(yàn)
室練習(xí)。由于這些模型很小，而且可以快速構(gòu)建，因此建立
每個(gè)已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的模型是可行的。

彎刀是由Byron H. Rubin和Jane S. Richardson在杜克大學(xué)
開(kāi)發(fā)的(在美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生研究院的支持下，Grant GM 15000)。

圖(1)紅發(fā)蛋白，顯示鐵原子及其四種半胱氨酸配體。模型是彎
從1/8 “鋼棒和鍍鎳。它大約5英寸高，比例尺為4毫米/?。

構(gòu)建蛋白α-碳模型的彎折如下圖所示。該儀器由三個(gè)基本元素
組成:一組兩個(gè)桿夾，一個(gè)旋轉(zhuǎn)鐵砧，和一個(gè)直讀彎錘。通過(guò)接
合動(dòng)夾，脫離固定夾，向前推進(jìn)動(dòng)夾，通過(guò)彎砧送出固定長(zhǎng)度
0.125″或3mm的鋼條。該坐標(biāo)系由沿蛋白質(zhì)主干的每個(gè)殘基的
一個(gè)距離、一個(gè)二面角和一個(gè)彎曲角組成。連續(xù)的α -碳Cn-1和
Cn之間的距離由千分尺設(shè)置確定。始終保持桿在至少一個(gè)兩個(gè)
桿夾允許二面角相對(duì)彎曲作為一個(gè)固定的參考系被測(cè)量。如果
An ‘是Cn-2Cn-1Cn面與Cn-1CnCn+1面之間的局部二面角，
則彎砧鼓表盤上顯示的累積二面角An為

在彎曲錘表盤上讀取彎曲角度Bn，并略微超調(diào)以保證鋼棒的彈性。

為了保證儀器的使用壽命，彎曲砧和錘子以及其他受應(yīng)力的零件已硬化洛氏45。

說(shuō)明材料提供與每個(gè)彎管機(jī)時(shí)，裝運(yùn)。詳細(xì)描述了彎曲模型的制
作過(guò)程。彎曲角度列表包括十個(gè)蛋白質(zhì)(胰島素，紅蛋白，胰蛋白
酶抑制劑，高潛力鐵蛋白，細(xì)胞色素b5，細(xì)胞色素C，鯉魚肌原，
葡萄球菌核酸酶，碳酸酐酶，乳酸脫氫酶)，并給出了截至1972年
5月出版的蛋白質(zhì)坐標(biāo)的文獻(xiàn)參考。

圖(2)核糖核酸酶S: S蛋白和S肽的主干在1/8”鋼棒和1/16”絲的
二硫鍵。模型是用彎管機(jī)制作的，尺寸為6毫米/?，直徑約為10英寸。