Supper Protein Wire Model Bender，也稱為 Byron’s Bender，將制作一體式蛋白質(zhì) α-碳模型

Supper Protein Wire Model Bender是一種通過將適當?shù)膹澢湃胍桓B續(xù)長度的鋼棒中輕松制作蛋白質(zhì)分子的 α-碳骨架模型的設(shè)備。這些模型可以按任何比例制作，小至約 4mm/?。在這種尺寸下，模型可以完全獨立，因此不需要額外的支持網(wǎng)絡(luò)。它們足夠小，只需要很少的存儲空間，并且足夠堅固，可以經(jīng)受住頻繁的處理和研究。

已經(jīng)有幾種好的蛋白質(zhì)模型可供使用，但它們都涉及將大量小塊精確地連接在一起，因此構(gòu)建的費用和難度限制了它們的使用。 幸運的是，彎曲機制作的簡單的一體式蛋白質(zhì)模型可以提供許多三維模型最有價值的功能. 它們以異常清晰的方式展示了每種蛋白質(zhì)的整體折疊模式，特別適用于比較一個分子內(nèi)或同源蛋白質(zhì)之間結(jié)構(gòu)相似的區(qū)域。通過將配體和一些選定的側(cè)鏈添加到主鏈中，這些模型顯示了酶活性位點的三維幾何形狀，這在生化實驗設(shè)計中通常很有用。這些骨干模型可用于教學目的，既可作為課堂展覽，也可作為實驗室練習，學生可以在其中制作自己的蛋白質(zhì)模型以進行學習和保存。由于這些模型很小并且可以快速構(gòu)建，因此構(gòu)建每種已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的模型是切實可行的。

該彎管機由杜克大學的 Byron H. Rubin 和 Jane S. Richardson 開發(fā)（在美國國立衛(wèi)生研究院的支持下，Grant GM 15000）。

圖（1）紅氧還蛋白，顯示鐵原子及其四個半胱氨酸配體。該模型由 1/8 英寸鋼棒彎曲并鍍鎳。它高約 5 英寸，比例為 4 毫米/埃。

用于構(gòu)建蛋白質(zhì) α-碳模型的彎曲機如下所示。該儀器由三個基本元件組成：一組兩個桿夾、一個旋轉(zhuǎn)砧和一個直讀彎錘。固定長度的 0.125″ 或 3mm 鋼棒通過折彎砧通過接合移動夾具、脫離固定夾具并將移動夾具推進到前進擋塊。坐標系由距離、二面角和沿蛋白質(zhì)骨架的每個殘基的彎曲角。連續(xù) α-碳 C?_n-1和 C?_n之間的距離由千分尺設(shè)置確定。始終將桿保持在兩個桿夾中的至少一個中允許二面角相對于作為固定參考系的折彎機進行測量。如果 A?_{n‘為C n-2}?C?_n-1?C?_n平面與C?_n-1?C?_n?C?_n+1平面之間的局部二面角，則彎砧鼓刻度盤上標明的累積二面角A?_n

為 桿以彎曲角度_Bn彎曲，該角度在彎曲錘刻度盤上讀取，帶有輕微的過沖量以允許鋼棒的彈性。

為確保儀器的使用壽命，彎曲砧和錘子以及其他承受應(yīng)力的部件都已硬化至 Rockwell 45。

每個彎管機在發(fā)貨時都提供說明材料。詳細描述了彎曲模型的過程。包括十種蛋白質(zhì)（胰島素、紅氧還蛋白、胰蛋白酶抑制劑、高電位鐵蛋白、細胞色素 b5、細胞色素 C、鯉魚肌原、葡萄球菌核酸酶、碳酸酐酶和乳酸脫氫酶）的彎曲角度列表，并為這些蛋白質(zhì)提供了參考文獻截至 1972 年 5 月出版的蛋白質(zhì)坐標集。

圖（2）核糖核酸酶S：1/8”鋼棒中S蛋白和S肽的骨架和1/16”鋼絲中的二硫鍵。該模型由彎曲機制成，尺寸為 6 毫米/埃，寬約 10 英寸。